電子體溫計是主要用于測量人體體表溫度，其使用方便，具有快速測溫、無需接觸、避免交叉感染的優點。使用電子體溫計測量體溫時，不需要再額外加0.5℃，因為電子體溫計顯示的數值即反映了所檢查部位的相應體溫數值。
如果使用電子體溫計測得的數值比水銀體溫計測得的數值低，也無需擔心其準確性，因為水銀體溫計通常測量的是人體深部的體溫，正常情況下，人體的體表溫度都會比人體深部的溫度低。但在使用電子體溫計時，需掌握正確的使用方法，從而保證檢查結果的準確性。
電子體溫計常用的測量部位為額頭部、腋窩部、手腕部等，在測量時要保證被檢測者的測量部位沒有遮擋、清潔干燥。臨床上比較常用的測量部位為腋窩部，腋溫的正常范圍為36-37℃之間，只要體溫沒有超過37.3℃都是正常的。為保證測量準確性，測量前盡量保持電子體溫計與被檢測人在同一環境下30分鐘后進行測量。因為體溫會受外界氣溫的影響，如果被檢測者在檢查前一直處于寒冷的環境，此種情況測得的體溫會偏低。如果被檢測者在檢查前長時間處于陽光暴曬或悶熱的環境，測得的體溫可能會偏高。
若腋溫超過37.3℃即為發燒，需要應用物理降溫的方法，如冰袋降溫、貼退熱貼、溫水擦浴等降低體溫。若體溫超過38.5℃則需要在醫生的指導下服用退燒藥物，如對乙酰氨基酚、布洛芬等，必要時需要去醫院就診，應用靜脈退熱藥物，如賴氨匹林等。
此外，電子體溫計平時不用時，應卸掉電池，放到陰涼干燥的地方，避免暴曬或因環境潮濕而引起器件老化，導致測量結果不準確。