富馬酸替諾福韋二吡呋酯片通常不易出現耐藥性，但是由于用藥時間、個人體質不同，部分患者可能會出現耐藥性，但具體用多久會出現耐藥，臨床上并沒有明確的數據支持。富馬酸替諾福韋二吡呋酯片可與其他抗逆轉錄病毒藥物聯用，治療成人HIV-1感染，除此之外還適用于治療慢性乙型肝炎。建議此類患者在用藥期間定期去醫院復診，遵醫囑按時按量使用富馬酸替諾福韋二吡呋酯片，嚴禁擅自停藥減藥。
在用藥期間，富馬酸替諾福韋二吡呋酯可能會導致患者出現乳酸性酸中毒或顯著的肝毒性，可告知醫生后暫停使用該藥物。而對于慢性乙肝患者，在暫停用藥期間，必須嚴密監測。停止治療后還要持續隨訪至少幾個月的時間，以防出現中斷后乙肝惡化。條件適當時，可遵醫囑重新開始抗乙肝病毒治療。