扁平疣是由人乳頭瘤病毒感染引起的皮膚病。在打干擾素期間，扁平疣有可能復發。如果患者在治療期間積極配合、免疫力較強且無其他不良因素影響，扁平疣復發的可能性相對較小；但如果治療不規范、免疫力低下或者再次接觸病毒等情況，扁平疣可能會復發。如有異常，需要及時就醫，遵醫囑處理。
扁平疣通常表現為皮膚上出現扁平的丘疹，一般無明顯疼痛或瘙癢。此時，可以使用外用藥物治療，如維A酸乳膏，可調節表皮細胞的增殖和分化，促進疣體消退；咪喹莫特乳膏，具有免疫調節和抗病毒作用；氟尿嘧啶乳膏，對扁平疣等疣狀病變有一定的治療作用。如果扁平疣沒有得到有效控制，可能會逐漸增多、增大。此時可以結合物理治療，如液氮冷凍治療，利用液氮的低溫使疣體組織壞死脫落；激光治療，利用高能量激光治療束直接作用于疣體，使其碳化、壞死。嚴重的扁平疣可能會影響患者的外貌和心理健康。同時個人身體情況的好壞，也在一定程度上決定著扁平疣的預后。身體素質好的患者，免疫系統相對較強，可能對治療的反應更好。
在打干擾素治療扁平疣期間，患者應注意保持良好的生活習慣，避免熬夜、過度勞累。加強營養，增強身體免疫力。避免搔抓疣體，防止自身接種傳播。