試管胎停是指在胚胎移植成功后，妊娠期間胎兒停止發育，即胚胎停育。導致胚胎停育的原因有很多，一般情況下與母體因素、胚胎因素、藥物因素以及心理因素等有關。
1、母體因素：做試管嬰兒的女性由于年齡因素導致卵子質量差，以及母體自身免疫性疾病，在妊娠期存在血液高凝狀態、高血壓、糖尿病、甲狀腺功能異常等，這些情況都可能會導致在做試管嬰兒后發生胚胎停育的現象；
2、胚胎因素：如果做試管嬰兒的父母雙方存在染色體異常的情況，一般在12周以前可能出現胚胎停育的情況。如果在超聲檢查中出現畸形兒，即使未出現胚胎停育，也不建議繼續妊娠；
3、藥物因素：做試管嬰兒女性如果在懷孕期間出現一些不適或者嚴重疾病，自行服用某些藥物，部分具有解熱鎮痛類以及活血化淤類的藥物也會導致胚胎停育，如阿司匹林、益母草顆粒等；
4、心理因素：在試管嬰兒移植時或者移植后，女性一直處于焦慮、緊張的情緒中，心理因素的刺激也可能導致胚胎停育。