月經結束三天后同房有淺褐色分泌物可能是月經并沒有完全結束、排卵期出血、細菌性陰道病、子宮內膜炎、宮頸炎等原因導致的，女性需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、月經并沒有完全結束：如果女性月經并未結束，可能會在月經停止后三天依然排出淺褐色的分泌物。這通常是正常現象，勤換衛生巾即可。
2、排卵期出血：有些女性的月經周期不規律，也有可能會在月經結束三天后開始排卵。在排卵期，由于孕激素水平降低，導致子宮內膜少量脫落，導致排卵期出血。如果女性沒有備孕的計劃，建議做好避孕措施。
3、細菌性陰道病：主要是由于細菌感染和個人衛生習慣的問題，引起白帶異常，外陰瘙癢、陰道不規則出血等。可以在醫生指導下使用保婦康栓、甲硝唑栓。
4、子宮內膜炎：這種疾病主要是由于子宮腔內病變或細菌感染引起的，主要表現為發熱、白帶異常、痛經等。可以在醫生指導下使用金剛藤膠囊、婦樂片等。
5、宮頸炎：這種疾病一般是由于同房受到了損傷，或者是細菌感染引起的，一般會有陰道分泌物增多、性交后出血等情況，可以在醫生的指導下口服阿奇霉素膠囊、金剛藤膠囊等。
女性需要注意私處的清潔，避免過度勞累。