通常來說，6個月小女孩因發熱嘔吐3天、驚厥兩次可能是小兒癲癇、植物神經紊亂、肺炎等原因導致的，建議按醫囑對癥治療，具體分析如下：
1.小兒癲癇：小兒癲癇是一種慢性腦功能障礙性疾病，發作時可能會出現兩眼發直、身體抽搐、面色青紫、口吐白沫、胡言亂語等癥狀，所以6個月小女孩因發熱嘔吐3天、驚厥兩次可能與小兒癲癇有關。建議家長按醫囑使用卡馬西平片、丙戊酸鈉片、苯巴比妥片等藥物進行治療。
2.植物神經紊亂：植物神經紊亂是一類由植物神經功能障礙引起的多系統機能紊亂，如果患有植物神經紊亂，可能會出現發熱嘔吐3天、驚厥兩次的情況。一般來說，家長可以按醫囑給小女孩使用維生素B1片、谷維素片、朱砂安神丸等藥物進行治療。
3.肺炎：肺炎是指終末氣道、肺泡和肺間質的炎癥，可能會出現咳嗽、咳痰、發熱、胸悶氣短等癥狀，所以6個月小女孩因發熱嘔吐3天、驚厥兩次可能是肺炎導致的。建議按醫囑使用阿奇霉素分散片、利巴韋林片、小兒肺炎散等藥物進行治療。