通常情況下，自然流產第5天孕酮可能會降低，通常是受體內激素變化的影響。具體分析如下：
孕酮是在受孕以后受到人絨毛膜促性腺激素的影響，刺激卵巢黃體所分泌出的一種孕激素，具有保護子宮內膜、維持妊娠等作用。一般來說，自然流產第5天孕酮可能會降低，因為在自然流產后通常會失去胎盤細胞的支持，可能會導致人絨毛膜促性腺激素水平不斷下降，進而孕酮也會隨之逐漸下降。
需要注意的是，自然流產后患者應該注意休息，避免過度勞累，同時應該做好自身保暖工作，加強營養，可以促進身體恢復。