吃糖心蛋黃后，主要會對身體造成胃腸不適等危害。日常生活中如果需要吃溏心蛋，建議使用無菌蛋制作，可以減少不適情況的發生。
糖心蛋一般指沒有完全煮熟的雞蛋，其蛋黃通常還呈半凝固狀態。市面上大部分雞蛋都不屬于無菌蛋，其受環境、母雞等多種影響，其中容易存在沙門氏菌等多種病原微生物。這些微生物雖然會對人體造成一定不良影響，但通過高溫蒸煮后，常可以將雞蛋中的微生物殺滅。而對于沒有完全煮熟的溏心蛋，由于加熱時間短、溫度低等影響，可能沒有將這些微生物完全殺滅。因此當人體吃了此種溏心蛋黃后，一般也會隨之攝入一定量的致病微生物，這些微生物就容易導致出現多種胃腸不適癥狀，如腹痛、腹瀉等，不利于機體健康。因此，對于普通的雞蛋，通常不建議將其制作為溏心蛋，以免影響自身健康。