若腸系膜淋巴結炎患者出現肚子疼的情況，大多繼發于上呼吸道感染，可具體表現為發熱、腹痛、腹瀉、惡心與嘔吐癥狀，可在醫生指導下行血常規、大便常規與腹部彩超等檢查，可遵醫囑服用應用抗感染藥物治療，可以緩解腹部疼痛，還可使用顛茄合劑，鹽酸山莨菪堿。還可用中成藥板藍根沖劑，小兒豉翹清熱顆粒，蒲地藍口服液治療診斷，指導治療。
1、抗生素治療：腸系膜淋巴結炎與病毒、細菌或寄生蟲感染有關，故以治療病原和對癥處理為原則。明確診斷后，應立即開始應用抗生素治療，再根據所分離的病原菌的藥敏情況調整抗生素。抗生素可選擇甲硝唑、左氧氟沙星膠囊等。由病毒所致者應聯合應用抗病毒藥物，如利巴韋林等；
2、解痙止痛藥：在疾病的急性發作期，患者可出現強烈的肚子疼癥狀，可在醫生指導下服用顛茄合劑、鹽酸山莨菪堿與布洛芬顆粒等解痙止痛藥物，這樣可有效緩解肚子疼的癥狀；
3、中成藥：主要包括板藍根顆粒與蒲地藍口服液，上述藥物具有良好的清熱解毒與抗菌消炎作用，另外也可選用柴胡疏肝散、香蘇散合方加白芷、重樓、浙貝治療，若患者的疼痛較嚴重，添加延胡索，腹脹便難者加萊菔子、檳榔，若合并咽紅，可酌情添加桔梗、連翹，這樣效果較好。
腸系膜淋巴結炎伴有疼痛的患者，應及時服用相關的抗感染藥物和止痛藥物治療，可盡快控制炎癥。如果局部形成膿腫，則需要手術治療，另外需要做好日常生活中的護理，加強營養，注意合理飲食，多飲水，少吃辛辣刺激油膩等不易消化的食物，增加休息時間，可有效促進病情康復。