生理性卵巢囊腫一般會自己消失。
生理性卵巢囊腫通常是由于卵巢的生理周期變化而形成的，例如濾泡囊腫和黃體囊腫。在女性的月經周期中，卵巢中的卵泡會逐漸發育成熟并破裂排出卵子，如果卵泡沒有破裂而是繼續生長，就可能形成濾泡囊腫；而在排卵后，黃體形成過程中如果出現異常，也可能形成黃體囊腫。
一般來說，如果是較小的生理性卵巢囊腫，在幾個月經周期后可能會自行消失。這是因為隨著月經周期的變化，體內的激素水平也會發生波動，這種變化可能會促使囊腫逐漸縮小直至消失。例如，一些女性在體檢時發現的小囊腫，在幾個月后的復查中可能就不見了。
然而，如果囊腫較大或者持續存在，就不一定會自行消失。較大的囊腫可能會對周圍的組織產生壓迫，引起腹痛、腹脹等不適癥狀。而且，如果囊腫長期存在，還有可能發生破裂、扭轉等并發癥，這是非常危險的情況，需要及時治療。
如果發現有生理性卵巢囊腫，醫生通常會建議定期復查超聲，觀察囊腫的變化情況。如果囊腫在觀察期間逐漸增大、出現癥狀或者懷疑有惡變的可能，可在醫生的專業指導下進行手術治療。
生理性卵巢囊腫有可能自行消失。患者應及時就醫，遵循醫生的建議進行觀察和復查。如果出現異常情況，應及時采取治療措施。