孕早期出血胚胎有可能會自己流掉，但也并非一定會如此，有些則不會，建議及時就醫診治。
1、會：孕早期出血可能是自然流產的征兆之一。如果出血量大且伴有腹痛，可能是胚胎本身質量不好，如染色體異常等，身體啟動自然淘汰機制，胚胎就有可能自行流掉。另外，如果孕婦存在內分泌失調、子宮畸形、免疫因素等問題，也可能導致胚胎發育不良而自然流產。在這種情況下，出血可能會持續加重，終胚胎流出。
2、不會：孕早期出血并不一定意味著會流產。有時可能是由于著床出血，這是正常的生理現象，一般出血量少且很快停止，對胚胎發育沒有影響。還有可能是因為孕婦勞累、性生活、孕酮水平偏低等原因引起的出血，經過休息、補充孕酮等保胎治療后，胚胎可以繼續正常發育。
總之，孕早期出血后胚胎是否會自己流掉不能一概而論，需要及時就醫，通過檢查確定出血原因，采取相應的治療措施。