黃芹和黃芩和黃芪的區別主要是性味不同、功效不同、作用不同等。
1.性味不同：
黃芹味甘微溫。歸肺、脾、肝、腎經。黃芪味甘，微溫。歸肺、脾經。黃芩味苦，寒。歸肺、膽、脾、大腸、小腸經。
2.功效不同：
黃芹的功效有益氣固表、斂汗固脫（止住過度的虛汗，防止虛脫）、托瘡生肌、利水消腫之功效。炙黃芹益氣補中，生用固表托瘡。
黃芩的功效有清熱燥濕（清除熱邪，干燥濕邪），瀉火解毒（清除體內熱毒邪氣），止血，安胎。
黃芪的功效有補氣升陽（補氣以使陽氣升發），固表止汗（通過鞏固肌表來止汗），利水消腫，生津養血（補充體內水液、血液），行滯通痹，托毒排膿，斂瘡生肌（幫助瘡口更快愈合，促進新肉生長）。
3.作用不同：
黃芹主要用于治療氣虛乏力，中氣下陷，久瀉脫肛，便血崩漏，表虛自汗（由于肌表虛弱頻繁自然出汗），癰疽難潰，久潰不斂（傷口潰爛一直不痊愈），血虛萎黃，內熱消渴等。
黃芹主要用于治療濕溫、暑濕，胸悶嘔惡，濕熱痞滿，瀉痢，黃疸，肺熱咳嗽，高熱煩渴，血熱吐衄（由于血熱引起吐血、鼻出血），癰腫瘡毒，胎動不安。
黃芪主要用于治療氣虛乏力，食少便溏，中氣下陷，久瀉脫肛，便血崩漏，表虛自汗，氣虛水腫，內熱消渴，血虛萎黃，半身不遂，痹痛麻木，癰疽難潰，久潰不斂。
除以上區別外，還有其他的可能性，如不良反應不同等，若身體出現不適，建議及時前往正規專業醫院進行就診。建議要在中醫師指導下用藥，不要擅自用藥。