超短波治療儀主要通過改善局部血液循環、加速組織再生、調節神經功能、調節內分泌等方式，到達治療效果。在臨床上適用于炎癥性疾病、疼痛性疾病，以及血管和自主神經功能紊亂、消化系統疾病、軟組織和骨關節疾病等的治療。活動性結核、青光眼、出血傾向、顱內壓升高、惡性腫瘤、心血管功能代償不全、置入心臟起搏器，以及嚴重心肺功能不全的患者，應避免使用超短波治療儀，并且孕婦也應避免使用，以免影響胎兒發育。
一、適應癥：1、炎癥性疾病：適用于軟組織、五官、內臟臟器的急性、亞急性炎癥，以及慢性炎癥的急性發作。超短波治療儀可以通過改善局部血液循環，增強毛細血管通透性，加強營養代謝，促進藥物進入病灶、清除炎性介質、病理產物、細菌病毒；
2、疼痛性疾病：適應于肌痛、神經痛、面神經炎、周圍神經損傷等患者。超短波治療儀主要通過降低感覺神經的興奮性，抑制傳導，從而起到鎮痛的作用。也可通過中小劑量超短波促進周圍神經再生，提高神經傳導速度；
3、血管和自主神經功能紊亂：適用于閉塞性脈管炎、雷諾氏病、直腸痙攣、胃賁門痙攣、食管痙攣等疾病。超短波可作用于自主神經結及神經叢，調節相應臟器與血管的功能；
4、消化系統疾病：適用于胃功能低下、消化性潰瘍、膽囊炎、慢性潰瘍性結腸等疾病，主要通過緩解平滑肌的痙攣，增強胃黏膜的血供和營養，從而改善胃腸道的吸收和分泌功能；也可促進膽汁的分泌；
5、軟組織和骨關節疾病：軟組織扭挫傷、肌肉勞損、肩關節周圍炎、頸椎病、腰椎間盤突出癥等。通過超短波，短時間內使血管進行收縮和擴張，改善局部血液循環，促進水腫的吸收。
二、禁忌癥：超短波治療儀的禁忌癥包括青光眼、活動性結核、顱內壓增高、出血性傾向、惡性腫瘤、心血管功能代償不全、置入心臟起搏器、嚴重心肺功能不全等疾病患者。妊娠期女性進行超短波治療時，超短波可能會引起子宮收縮，對胎兒產生一定刺激，嚴重者可能會導致流產；對于出血性傾向的患者，超短波可能導致受創傷，引起出血；對于置入心臟起搏器的患者，超短波治療屬于一種電場作用，使用時可能會對心臟起搏器造成干擾，影響心臟起搏器正常工作。
另外，超聲波治療儀還可對燒傷、凍傷、胃及十二指腸潰瘍、急性腎衰竭、痛經等患者進行治療，如燒傷時，可在早期應用超短波治療儀，加速較小水泡吸收消退。若已出現破潰，可加快結締組織、肉芽組織的生長，加速傷口愈合。