現階段，科興疫苗通常是指國產新型冠狀病毒滅活疫苗。一般來說，注射國產新型冠狀病毒滅活疫苗后的不良反應，主要為接種部位不良反應和全身不良反應。但出現不良反應的概率低，不需要過于擔心。
接種國產新型冠狀病毒滅活疫苗后，接種部位不良反應一般以疼痛為主要表現，常見為接種部位出現腫脹、紅暈癥狀。偶爾出現硬結、皮疹、瘙癢等癥狀。極少數受種者可能會出現感覺減退、感覺異常、紅斑、變色、不適、發熱等癥狀。
大多數受種者，在接種國產新型冠狀病毒滅活疫苗后可出現頭痛、疲乏等不良反應。部分接種者可出現肌痛、咳嗽、口咽疼痛、發熱、流涕等不良反應。少數接種者可出現鼻塞、打噴嚏、嗜睡、嘔吐、腹痛等不良反應。極少數受種者可能會出現味覺障礙、嗅覺喪失、頭部不適、體溫降低、發聲困難等癥狀。
依據目前臨床試驗觀察，未發現國產新型冠狀病毒滅活疫苗存在3級及以上不良反應和嚴重不良事件。新型冠狀病毒滅活疫苗基礎免疫為2劑次，每劑間隔21~28天。
建議接種新型冠狀病毒滅活疫苗后，應在原地觀察30分鐘，若出現不適癥狀，應及時就診，以免延誤病情。