在臨床上，女性胱抑素C偏低通常意義不大，多見于機體排出體內多余廢物，導致短期內腎小球濾過率上升，而引起，一般無需進行治療，不用過于緊張。
一般機體內所有有核細胞均可以產生胱抑素C，且產生速度較為恒定。而僅有腎臟能排泄血清中的胱抑素C，所以血清胱抑素C的濃度主要由腎小球濾過率決定，越低代表排泄廢物越多，提示腎功能良好。
胱抑素C是一種小分子物質，一般可以自行穿過腎小球濾過膜，通常在近曲小管被重吸收并迅速分解、代謝，而且其血清濃度變化與性別、年齡、飲食以及肌肉量等無關，相較于肌酐，通常能夠較為精確地反映腎小球濾過率的變化。測定胱抑素C的濃度，通常可用于糖尿病腎病患者腎臟濾過功能早期損傷的評價、高血壓腎功能損害早期診斷，以及評價腎移植患者腎功能恢復情況。