在屋里養鳥可能會導致人類感染上傳染病，比較典型的傳染病是衣原體病，暴發癥狀是開始時發燒、渾身發冷、頭疼、全身乏力及肌肉疼痛，也可能發生伴隨著呼吸困難的干咳和胸悶，感染可能導致心內膜炎、心肌炎、肝炎、關節炎、角膜結膜炎和腦膜炎等疾病的發生。
衣原體病的嚴重程度從不明顯的生病到伴隨著肺炎的系統性疾病，經過恰當治療卻死于衣原體感染的人類占比較小。無癥狀攜帶的鳥身上很難診斷出衣原體病，主動在排泄物中散播細菌機體，在環境中保持相當穩定的狀態長達幾個月，被人類吸入后，通常會發展成感染。此外，其它接觸途徑包括嘴對喙的接觸，以及處理感染鳥兒的羽毛、身體組織時輕微接觸，也會導致感染。
如果在屋里養鳥，建議鳥具、籠子1周至少清洗一次，水盒、食盒、糞便至少2天清理一次，每個月做1次徹底的清潔消毒，定期給鳥進行藥浴，并且0.5年為鳥做1次體內驅蟲，防止出現寄生蟲。