由于個體差異，沒有“跑步膝蓋疼用什么藥最有效”的固定說法。一般情況下，跑步膝蓋疼可能是神經痛、關節炎、缺鈣等因素引起的，在醫生指導下用對癥的藥比較有效。具體分析如下：
1.神經痛：若跑步時膝蓋疼是神經痛引起的，患者可以遵醫囑用甲鈷胺片、維生素B12片、谷維素片等營養神經的藥，能夠比較有效地緩解神經痛的情況。
2.關節炎：若患有關節炎，跑步膝蓋疼可能是炎癥刺激導致關節痛引起的，患者可以在醫生指導下用尼美舒利分散片、布洛芬膠囊、塞來昔布膠囊等藥，可較為有效地緩解關節炎引發的疼痛。
3.缺鈣：跑步膝蓋疼也可能是缺鈣造成的，患者可以在醫生的指導下用碳酸鈣片、泛酸鈣片、乳酸鈣片等補鈣的藥，補充機體鈣質，進而較為有效地緩解不適。