中藥中的牡蒿和青蒿雖然都屬于菊科蒿屬植物，但它們?cè)谕庥^、藥用部位以及功效上存在顯著差異。
從形態(tài)上看，牡蒿的葉子較大，呈羽狀深裂，邊緣有鋸齒，莖下部的葉常常排列成蓮座狀；而青蒿的葉片則細(xì)長(zhǎng)如絲，呈二至三回羽狀全裂。花期時(shí)，牡蒿的花序緊密排列成狹窄圓錐狀，而青蒿的花序較為松散。
在藥用部位上，牡蒿通常以全草入藥，采收時(shí)間多為秋季；青蒿則主要使用花蕾期的嫩枝葉，現(xiàn)代提取青蒿素時(shí)更注重葉片部分。兩者干燥后都呈黃綠色，但青蒿的味道更加濃郁。
從性味歸經(jīng)來看，牡蒿性微寒，味苦，主要用于治療濕熱黃疸和皮膚瘙癢；而青蒿性寒，味苦辛，除了清熱解暑外，其提取物青蒿素是國際上公認(rèn)的抗瘧疾特效藥。
在化學(xué)成分方面，牡蒿含有揮發(fā)油、黃酮類以及牡蒿素等物質(zhì)，具有保肝利膽的作用；青蒿則富含青蒿素和蒿甲醚等倍半萜類化合物，這些成分能夠有效破壞瘧原蟲的細(xì)胞結(jié)構(gòu)。
現(xiàn)代應(yīng)用中，牡蒿多用于輔助治療肝炎及皮膚科外用制劑；而青蒿及其衍生物（如蒿甲醚注射液、雙氫青蒿素片、青蒿琥酯片）是瘧疾治療的一線藥物。近年來研究表明，青蒿還可能對(duì)免疫調(diào)節(jié)具有潛在作用。
需要注意的是，在使用含有青蒿素的藥物時(shí)，必須嚴(yán)格遵循醫(yī)生的指導(dǎo)，避免與某些抗心律失常藥物同時(shí)使用；而牡蒿外用前也應(yīng)進(jìn)行皮膚敏感性測(cè)試。兩種藥材均應(yīng)在中醫(yī)師的指導(dǎo)下使用，切勿自行配伍或過量服用，尤其是孕婦和體質(zhì)虛弱者更需謹(jǐn)慎。
在日常儲(chǔ)存中，不論是牡蒿還是青蒿，都應(yīng)存放在陰涼干燥的地方，以防止有效成分的揮發(fā)和損失。
