3個月嬰兒大便隱血陽性，可能是生理性因素引起，也可能是因為乳糖不耐受癥、急性胃炎等因素引起。若伴隨其他不適，建議及時到醫院的小兒消化科就診，遵醫囑針對性進行治療。
一、生理性因素：若母親乳頭皸裂出血，導致嬰兒吞入的母乳中含有血液，或母親攝入過多含鐵豐富的食物或藥物，如豬肝、豬血，以及復方硫酸亞鐵顆粒等，可導致母乳中含鐵量增加，導致3個月嬰兒大便隱血陽性。此時為正常現象，無需過分擔心，在改善飲食以及乳頭皸裂恢復后，通常可恢復正常。
二、病理性因素：1、乳糖不耐受癥：通常是腸道內缺乏乳糖酶而引起，若家長不注意而導致給嬰兒喂養過多牛奶等含有乳糖的物質，可導致嬰兒出現較為嚴重的腹瀉，損傷腸道，從而導致出現大便隱血陽性的情況。此時建議更換無乳糖或低乳糖的牛奶進行喂養，以緩解不適癥狀；
2、急性胃炎：若嬰兒受到病毒、細菌等微生物入侵，可引起急性胃炎，而病毒或細菌毒素，可損傷胃腸道黏膜，進而引起大便隱血陽性的情況，可伴隨出現腹痛、腹瀉、嘔吐等癥狀。此時建議通過服用布拉氏酵母菌散等藥物保護胃腸道黏膜，對抗細菌以及病毒感染，從而緩解上述情況。
此外，若出現腸道壞死、腸腫瘤等情況，也會引起大便隱血陽性，但其可能性較小，通過進行腹部B超等檢查可幫助排除此類可能性。建議在日常生活中，進行母乳喂養的母親，應當注意盡量避免進食辛辣刺激性的食物，以免影響嬰兒的胃腸道功能。