頭皮有黃顏色晶體一般是由脂溢性皮炎、頭癬等疾病引起的，患者可以醫院進行皮膚活組織檢查、真菌培養及鑒定等，明確病因，再通過生活護理、藥物治療等方式改善癥狀。
1、脂溢性皮炎：脂溢性皮炎好發于頭皮、面部、胸部、背部等皮脂腺分布較多且皮脂分泌旺盛的部位。頭皮清潔不到位、飲食習慣不良、長期情緒緊張、免疫功能失調等都可能導致患者頭皮出現黃紅色斑片樣皮損，皮損表面附有鱗屑，伴瘙癢癥狀，當皮損自然修復后就會形成黃顏色的晶體物質。如果晶體物質自然掉落表示皮損恢復，患者無需特殊處理；如果晶體物質被患者扣掉，可能會導致皮炎反復或皮損擴大，引起脫發、瞼腺炎、結膜炎等。患者可以遵醫囑使用酮康唑乳膏、他克莫司軟膏、紅霉素軟膏等藥物涂抹在皮損部位，進行消炎治療。
2、頭癬：頭癬是皮膚癬菌感染頭皮所導致的，主要分為黃癬、白癬、黑點癬、膿癬四種類型。無論哪一類型，都是具有傳染性的，患者在密切接觸患病動物、癬病患者等病原體后，有很大幾率會被傳染。患者頭皮會出現不同程度的脫發、瘙癢、皮損等癥狀，其中黃癬患者頭皮會出現針尖大小的淡黃色皮損，皮損表面覆蓋薄片狀鱗屑，隨著病情的發展，淡黃色皮損會不斷擴大，且皮損周邊翹起，中央緊附著頭皮。淡黃色皮損暴露在空氣中會凝結成黃顏色晶體，有異物感。頭癬以藥物治療為主，患者可以遵醫囑使用聯苯芐唑乳膏、盧立康唑乳膏、鹽酸阿莫羅芬搽劑等抗真菌藥物治療。
治療期間患者要保持飲食清淡、營養均衡，適當吃富含維生素和水分的食物，促進頭皮新陳代謝。定期使用清水和無刺激的洗發露清潔頭皮，保持頭皮的衛生和干燥。