藥物性耳聾基因是母系遺傳。藥物性耳聾基因為MT-RNR1，屬于線粒體遺傳基因，精子中不存在任何線粒體，只有母親卵子中的線粒體能夠被遺傳，因此藥物性耳聾基因為母系遺傳。
藥物性耳聾是指因感冒、感染等原因使用氨基糖苷類藥物或抗生素，引發聽力受損或耳聾。攜帶突變線粒體DNA的人群會對氨基糖苷類抗生素具有高度敏感性，在使用氨基糖苷類藥物或抗生素后，很大程度會發生嚴重的聽力受損，且癥狀會不斷加劇。
在受精卵的行程中，來自母親卵子的細胞核和線粒體中的遺傳物質會全部帶給下一代，而來自父親的精子只有細胞核中的遺傳物質會帶給下一代，而線粒體中的遺傳物質并不會遺傳下去。因此線粒體的遺傳特點是，如果母親有線粒體突變，其下一代不管男女都會有與母親相同的線粒體突變，如果父親有線粒體突變，母親正常的話，其下一代線粒體都為正常。
存在線粒體突變的人群，應禁止使用耳毒性藥物，如鏈霉素、卡那霉素、慶大霉素、新霉素、萬古霉素、紫霉素等，防止聽力下降，并且人群要密切關注自己的聽力情況，如果出現聽力下降的情況，應及時前往耳鼻咽喉科進行聽力檢查。