陰莖根部長了個小疙瘩可能與珍珠狀陰莖丘疹、皮脂腺異位癥、生殖器皰疹、龜頭炎、尖銳濕疣等因素有關，建議患者及時就診，以明確情況。
1、珍珠狀陰莖丘疹：主要與局部刺激和生理發育的變異等因素有關，陰莖根部可能出現白色、黃色或淡紅色的微小丘疹，此類丘疹像珍珠一樣，之間沒有相互融合。
2、皮脂腺異位癥：是由于皮脂腺的生理發育異常和增生導致的，有明顯瘙癢感，可在局部出現針尖般大小的硬結或結節，也可以形成囊腫，表面有膿痂。
3、生殖器皰疹：是一種由單純皰疹病毒引起的性傳播疾病，龜頭的根部可能會出現細小的水皰，其液體非常清澈，但隨后可能會破裂，形成潰瘍和糜爛，并伴隨著疼痛和瘙癢等不適。
4、龜頭炎：可能是由細菌、真菌等微生物感染導致的，陰莖根部可能出現疙瘩，龜頭還可能出現紅腫、疼痛、瘙癢和分泌物增多等多種癥狀。
5、尖銳濕疣：是一種由人乳頭瘤病毒引起的，主要通過性行為傳播的疾病，臨床主要表現為成簇分布于外生殖器和肛門周圍皮膚表面的疣狀突起，可能有瘙癢及灼痛感。
在明確情況后，應積極配合醫生進行干預，切忌盲目采用偏方，以免對機體產生嚴重的負面影響。