做胃鏡檢查要活檢的目的，是為了進一步明確胃部疾病診斷，排查腫瘤性疾病或明確腫瘤疾病的性質，為確定治療方案提供依據。一般在發現有胃息肉、嚴重胃黏膜糜爛、胃潰瘍、胃部異常包塊或隆起等情況下需要做活檢。
胃鏡能發現食管、胃和十二指腸的炎癥、潰瘍、息肉、腫瘤、血管曲張、出血等病變，是檢查食管、胃和十二指腸疾病的重要手段之一，如果在做胃鏡檢查的時候，發現新生物或不典型改變時，此時需要做活檢，采集到胃病變組織的病理標本，可送快速病理檢查，病理科醫生采用相應的技術處理標本，并且在顯微鏡下觀察，明確病變組織的性質、來源。病理診斷是目前疾病診斷的金標準，在判斷良惡性后，可以在胃鏡下治療，過程較為方便、快捷，可以減少患者的痛苦。
胃鏡活檢可早期發現胃癌和癌前病變、篩查胃癌，因此胃鏡檢查非常重要，如果患者經常出現胃部不適或是本身有胃腸道疾病，可以定期進行胃鏡檢查。