扁平疣變平但不掉可能是治療不徹底、局部免疫反應未完全消退、病毒殘留、皮膚修復緩慢、個體差異等原因。建議及時就醫，遵醫囑處理。
1.治療不徹底：可能之前的治療方法未能完全清除扁平疣病毒，導致疣體變平但未脫落。可在醫生的指導下外用氟尿嘧啶乳膏、人干擾素α2b凝膠等藥物治療，繼續發揮抗病毒的作用。
2.局部免疫反應未完全消退：扁平疣的消退需要機體免疫系統的參與，免疫反應未完全消退時，疣體可能變平但不掉。可遵醫囑服用轉移因子口服溶液、匹多莫德顆粒、胸腺肽腸溶膠囊等藥物，調節免疫功能，促進疣體脫落。
3.病毒殘留：部分病毒可能仍潛伏在皮膚組織中，導致扁平疣難以完全脫落。可考慮再次進行物理治療，如液氮冷凍治療，其原理是利用低溫使疣體組織壞死脫落；或激光治療，利用激光的熱能破壞疣體組織。
4.皮膚修復緩慢：疣體變平后，皮膚的修復過程可能較為緩慢，導致疣體看起來未脫落。可在醫生的指導下外用人表皮生長因子凝膠、維生素E乳、尿素軟膏等藥物，促進皮膚修復。
5.個體差異：不同人的身體狀況和免疫功能不同，扁平疣的消退速度也會有所差異。應保持耐心，繼續觀察，同時注意增強免疫力，如合理飲食、適度運動、保證充足睡眠等。
日常注意保持皮膚清潔，避免搔抓疣體，防止病毒擴散。避免接觸刺激性物質，減少對皮膚的刺激。