兩歲寶寶長疣一般是人乳頭瘤病毒感染導致的，可能是皮膚外傷、免疫力低下、他人傳染等原因引起的，具體情況分析如下：
1.皮膚外傷：兩歲寶寶較為貪玩，平時玩耍不注意可能會導致皮膚出現外傷，人乳頭瘤病毒從傷口處侵入體內，引起長疣。
2.免疫力低下：兩歲寶寶免疫力低下，自身抵抗力比較差，一旦感染人乳頭瘤病毒，寶寶并沒有足夠的抵抗力可以消除人乳頭瘤病毒，可能會導致長疣。
3.他人傳染：寶寶可能接觸到了感染人乳頭瘤病毒的患者，導致傳染，進而導致寶寶長疣。
一般情況下，兩歲寶寶長疣，家長可以帶寶寶去醫院采取冷凍療法、激光治療等物理方法來治療。