三代試管即胚胎植入前遺傳學診斷/篩查技術，可有效避免因胚胎染色體異常導致的胎停發生，但仍有可能發生胎停。胚胎發育受多種因素影響，如胚胎質量、生育年齡、母體免疫、凝血、子宮內膜容受性等，因此僅保證胚胎染色體正常的情況下，仍可能有胎停的發生。
胚胎的發育過程復雜且精細，任何一個環節出錯都可能會導致胎停。三代試管胚胎染色體多是正常，但并不代表胚胎質量就優秀，發育潛能也有差異，因此若胚胎質量較差(如4CC級別囊胚)，仍會有一定的概率著床失敗或者胎停；生育力跟年齡成反比，同樣胚胎質量的情況下，年齡越大則胎停率越高，一般35-37歲以后再做試管，即便是通過三代試管的篩查，仍有一定概率胎停；母體免疫異常(如封閉抗體缺乏)時，對胚胎的識別能力降低，攻擊性增加，影響胚胎發育，即便是通過三代試管的篩查，仍有一定概率胎停；凝血功能異常時，如血小板聚集率升高，會導致子宮內膜微血栓形成，影響母胎循環建立，即便是通過三代試管的篩查，仍有一定概率胎停；子宮內膜容受性代表子宮內膜對胚胎的接納能力，如子宮內膜息肉、宮腔粘連等，會使子宮內膜容受性下降，即便是通過三代試管的篩查，仍有一定概率胎停。
經過遺傳學篩查的胚胎總體成功率都比較高，不必過度擔心，胚胎移植后注意避免受涼勞累，嚴格遵醫囑用藥，保持放松心態，養成良好的生活作息習慣即可。