心率變異是指心率變異性，當心率變異性為39毫秒時，一般是不正常現象，可能是心律失常、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病等疾病引起的。
心率變異性是指逐次心跳周期差異的變化情況，其含有神經體液因素對心血管系統調節的信息，從而判斷其對心血管等疾病的病情及預防。進行該項檢查時，一般有SDNN、SDANN等指標，其中SDNN的正常值為(141±39)ms；SDANN的正常值為(127±35)ms。因此，根據上述指標的正常范圍進行判斷，心率變異性39毫秒是一種不正常的情況，患者需要積極配合醫生進行治療。
如果是心律失常引起的，患者可在醫生的指導下服用鹽酸普羅帕酮片、鹽酸胺碘酮片等藥物進行治療。如果是冠狀動脈粥樣硬化性心臟病引起的，患者可遵醫囑服用硝酸異山梨酯緩釋片、酒石酸美托洛爾緩釋片等藥物進行治療，必要時可通過經皮冠狀動脈介入治療、冠脈搭橋術等手術進行治療。
當患者進行檢查時得到上述結果，需要進一步完善動態心電圖、超聲心動圖、冠狀動脈CT等檢查，以明確診斷并對癥治療。平時注意保持規律的作息，避免熬夜；保持飲食營養均衡，避免吃高糖、油膩的食物。