牙齒刷不干凈有牙垢很臭，一般需就醫進行處理，常見的辦法是通過齦上潔治術進行改善，通俗稱為洗牙，必要時還需結合根面平整，一般治療效果也較好，治療后需注意加強口腔護理。
牙垢又稱牙菌斑，剛開始附著于牙齒表面比較軟，可以通過刷牙將其去除，但如果長時間清理不干凈就會沉積在牙齒表面鈣化形成牙菌斑，通常呈黃白色或棕黑色，可伴隨牙齦出血、牙齦萎縮、口臭等癥狀，長期不清理牙菌斑還可引起牙齦炎、牙周炎等疾病的出現。
牙結石必須就醫通過洗牙去除，醫生用手動的潔治器或者用超聲潔治器，通過震蕩的方法去除附著于牙周袋內牙根表面上的齦下牙石和菌斑，以減輕口臭。但如果檢查口腔時發現已出現慢性牙周炎可能還需要通過根面平整去除附著和嵌入牙骨質內的牙石，并刮除牙根表面受到毒素污染的病變牙骨質，從而形成光滑、堅硬且清潔的根面，降低口臭程度。
因此，牙齒刷不干凈有牙垢很臭時，建議及時前往口腔科就診治療。此外，應注意定期復查，日常生活中注意保持口腔清潔，按時刷牙。