早晨吐痰發黃褐色可能是長期吸煙、環境污染、上呼吸道感染、肺炎、支氣管炎、肺結核、肺癌因素導致，建議明確診斷后進行針對性治療。
1、長期吸煙：長期吸煙可能會吸入大量的尼古丁、焦油等物質，這些物質會進入肺部刺激肺組織損傷，就會引起咳痰的現象，煙草中的物質混合在一起可能就會出現痰發黃褐色的現象，建議戒煙。
2、環境污染：若生活環境污染嚴重，存在很多的飛沙以及汽車尾氣，若出門吸入大量的污染空氣，可能會引起唾液或者鼻腔黏液中混合這些物質，早晨吐痰時出現痰發黃褐色的現象，建議出門戴口罩。
3、上呼吸道感染：若是出現了鼻炎、咽炎等上呼吸道感染的現象，由于炎癥侵犯呼吸道黏膜，可能會導致黏膜通透性增加引起炎性滲出，早晨吐痰時可出現黃褐色痰的情況，可以遵醫囑進行抗感染治療，如頭孢克洛膠囊、鹽酸左氧氟沙星片等。
4、肺炎：若患有肺炎，在炎癥的刺激下導致毛細血管通透性增高，也可引起漿液滲出，若是金黃色葡萄球菌感染，一般為黃色痰液，因此會出現早晨吐痰時會有黃褐色表現，建議遵醫囑使用阿莫西林膠囊治療。
5、支氣管炎：若支氣管受到病原菌感染出現炎癥，在炎癥的刺激下會導致支氣管黏膜通透性增加，導致大量中性粒細胞、淋巴細胞滲出形成痰液，出現吐痰發黃褐色的現象，建議遵醫囑使用鹽酸氨溴索分散片進行祛痰治療。
6、肺結核：由于結核分枝桿菌感染導致細菌刺激毛細血管壁通透性增加，可有漿液滲出，可能就會出現早晨吐黃褐色痰的現象，建議遵醫囑使用異煙肼片等藥物進行抗結核治療。
7、肺癌：若患有肺癌，癌細胞會刺激肺部組織導致肺部組織損傷而引起出血，在咳痰時會伴隨癌細胞以及血液一同出來，可能會出現早晨吐痰混合黃褐色的現象，建議通過放、化療的方式進行治療。
如果持續出現早晨吐痰發黃褐色的情況，建議及時就診于呼吸內科，通過完善血常規檢查、痰液檢查、胸部X線檢查、肺通氣功能檢查等明確診斷。