一般情況下，咳嗽時肚子疼可能是肌肉拉傷、肺結核、胰腺炎等原因引起的，具體需要根據不同的原因作出針對性的治療，具體分析如下：
1.肌肉拉傷：若咳嗽時過于劇烈，造成肌肉拉傷，便可能導致肌肉痙攣，從而引起腹痛，所以咳嗽時肚子疼可能是肌肉拉傷引起的，通常會隨著咳嗽的好轉而慢慢減輕。
2.肺結核：若肺結核是細菌感染引起的，肺結核病情加重，細菌蔓延至腹腔，便可能引起咳嗽時肚子疼。患者可以在醫生的指導下口服阿莫西林膠囊、鹽酸乙胺丁醇膠囊、利福平片等藥物進行治療。
3.胰腺炎：胰腺炎可能會出現惡心、發熱、腹痛等癥狀，咳嗽時容易導致腹痛癥狀加劇，進而引起咳嗽時肚子疼。患者可以在醫生的指導下使用奧美拉唑鎂腸溶片、蘭索拉唑片、注射用鹽酸羅沙替丁醋酸酯等藥物進行緩解。