通常情況下，嬰兒做頭顱B超能不能查出腦損傷，需要根據腦損傷的嚴重程度來判斷，如果腦損傷程度較輕，一般不能查出；如果腦損傷程度比較嚴重，一般能查出。具體分析如下：
1.不能查出：嬰兒做頭顱B超檢查一般能查出有沒有腦積水、脈絡叢囊腫等腦部病變，對于腦損傷的診斷效果一般比較差，如果嬰兒腦損傷的程度較輕，如輕度大腦挫傷或者腦震蕩等，做頭顱B超檢查，可能無法成像，因而不能查出腦損傷。
2.能查出：頭顱B超主要運用聲波頻率顯像來進行診斷，如果嬰兒腦損傷的程度比較嚴重，如腦內有大血塊、腦積水等，在做頭顱B超的過程中，聲波頻率比較高，成像比較清晰。因此，做頭顱B超一般能查出腦損傷，但具體的情況還需要結合腦部CT、核磁共振等檢查結果來判斷。