凌晨1一3點頭痛可以在醫生的指導下采用降血壓的藥物治療、也可以服用抗凝血的藥物治療，必要的時候還需要采用止痛的藥物緩解疼痛。導致疼痛的原因有很多，想要根本性的解決疼痛應該及時到醫院去做檢查在醫生的判斷下，根據病情采用藥物治療才能夠達到比較好的治療效果。
1、采用降壓藥治療：
當患者出現高血壓癥狀的時候，有可能會出現突發性的血壓升高，血壓升高可能會導致顱內壓增高，引起患者頭痛，在醫生的指導下服用降血壓的藥物治療，比如硝苯地平片、阿米洛利、呋塞米等藥物都能夠相對穩定地控制血壓。
2、采用抗凝血的藥物：
患者出現腦梗塞的時候，也有可能會引起頭痛的癥狀，腦梗塞屬于一種突發性的疾病，應該立即到醫院去做腦部CT檢查或者是血管造影檢查明確具體的病灶位置，采用合適的方法治療，通過服用阿司匹林、重組組織型纖溶酶原激活劑的方式都有助于緩解腦血栓，還可以采用依達拉奉能夠改善腦部血栓，保護腦功能。
3、采用止痛藥物治療：
如果是感冒或者是神經性的疼痛，可以采用布洛芬、對乙酰氨基酚等藥物治療。