肺CT對肺部的檢查比較單一，主要是重點觀察雙肺形態、病灶及一些呼吸狀況。而胸CT檢查范圍較廣，可檢查肺部及其他胸部軟組織、器官，如肺部胸膜、肋骨、心臟、乳腺等，并且肺CT可包括在胸CT內。二者所檢查的方式、部位范圍、重點有所不同，所以無法單純比較哪個看得細。
肺CT主要用于觀察肺窗及縱隔窗，從而判定有無肺部感染、肺大皰、肺腫瘤等肺部病變，對雙肺以外的組織、器官等通常無法詳細拍攝。而胸CT不僅可觀察肺部病變，還可觀察肋骨、胸骨、心臟、胸膜等胸部其他組織、器官，明確病灶范圍、大小及是否累及其他部位等。二者的檢查原理雖相同，但重點觀察的部位和方式有所不同。
如果患者明確罹患肺炎、肺腫瘤等肺部疾病，可先進行肺CT檢查。若伴隨有哮喘、氣短、胸悶等其他不適癥狀，可選擇胸CT檢查，觀察是否有其他疾病存在，或肺部疾病是否累及胸部其他部位。