新生兒生下來肛門有小肉坨可能是脫肛、肛周膿腫、直腸息肉等原因造成的，可對癥處理。
1、脫肛：由于新生兒盆腔組織發育不完善，直腸比較松弛，可能出現脫肛，有肛門濕潤、直腸黏膜脫出等表現，較為輕微時一般可以隨著新生兒成長自行還納，較為嚴重時可通過溫水坐浴促進還納。
2、肛周膿腫；因為新生兒免疫力較差，如果肛周受到感染，就可能出現肛周膿腫，一般在肛門會有紅腫包塊，還伴隨疼痛，新生兒可能會通過頻繁哭鬧表達不適。家長應注意幫助新生兒保持局部衛生，做好防護，加強日常護理使其體質增強，病情較為嚴重時可通過手術切開引流。
3、直腸息肉：新生兒在母體中時，由于上皮組織在生長發育期快速生長，就可能出現直腸息肉，如果息肉距離肛緣比較近，就可以看見。因為新生兒過小，不建議手術治療，可以暫時多加觀察，幫助其做好肛周清潔護理。
此外，少數情況下，尖銳濕疣、肛乳頭瘤、直腸腺瘤等也可能造成該現象，可及時就醫明確原因并治療。