瞳孔不圓的原因較多，常見于眼外傷、角膜潰瘍、青光眼、虹膜睫狀體炎或前葡萄膜炎、視神經疾病等情況。建議及時到醫院進行相應檢查，明確原因后進行針對性治療。
1、眼外傷：多見角膜穿通傷、眼球鈍挫傷等情況，可以直接損傷瞳孔括約肌，使其痙攣或者麻痹，引起瞳孔縮小或者擴大，外傷還可以引起玻璃體涌入后房或者前房，出現瞳孔不圓的現象。應及時到醫院進行相應的治療，一般需要手術治療恢復眼睛外形，如玻璃體涌出，可以考慮前部玻璃體切割手術治療。如果眼睛伴有感染，還需要使用抗生素進行抗感染治療，如紅霉素、氯霉素等；
2、角膜潰瘍：主要是細菌、真菌等病原體感染引起，如果導致角膜穿孔，可以引起虹膜粘連，可導致瞳孔變形、不圓。需要采取敏感的藥物治療，如細菌感染，常需要鹽酸左氧氟沙星、氯霉素等滴眼液治療，嚴重者可以考慮手術分離粘連的瞳孔；
3、青光眼：急性青光眼發作時眼壓升高，可以引起虹膜缺血，累及瞳孔括約肌，導致瞳孔呈現縱橢圓形擴大，從而表現為瞳孔不圓。對于此現象需要降眼壓治療，常見的滴眼液有馬來酸噻嗎洛爾滴眼液、布林佐胺噻嗎洛爾滴眼液等。新生血管性青光眼可以考慮激光光凝治療，或者局部注射康柏西普眼用注射液等藥物治療；
4、虹膜睫狀體炎或前葡萄膜炎：常由炎癥刺激導致，可以引起虹膜后粘連，出現小瞳孔或者梅花樣瞳孔，表現為瞳孔不圓。需要使用散瞳藥，如阿托品等，糖皮質激素，如醋酸潑尼松龍滴眼液，非甾體藥物，如普拉洛芬滴眼液等進行治療；
5、視神經疾病：如視神經炎、缺血性視神經病變、視神經萎縮等疾病，可以引起瞳孔擴大，甚至可能導致直接對光反射遲鈍或者消失，表現為瞳孔不圓。治療方面常需要營養神經的藥物，如神經節苷脂、維生素B12等，以及改善微循環的藥物，如復方丹參片等。
此外，對于嬰幼兒的瞳孔不圓，可能是先天性發育異常導致，如先天性虹膜缺損，如果沒有不適癥狀，一般不需要處理。若缺損較大或有畏光等不適癥狀，需要手術修補治療。