云南白藥涂口腔潰瘍有用，但是效果不是很明顯，聯合使用其他藥物進行治療比較好，常見藥物有口腔潰瘍散、冰硼散、復方苯佐卡因凝膠、西地碘含片等。
1、云南白藥：屬于中成藥，是由三七、大麻藥等藥物制成，具有止血、活血、止痛、消腫等功效，臨床上主要用于跌打損傷、瘀血腫痛等不適，對于口腔潰瘍也有一定作用，可以達到消腫、止痛的目的。
2、口腔潰瘍散：是由青黛、白礬、冰片組成，可以達到清熱斂瘡、消潰止痛的功效，主要用于治療口腔潰瘍，效果相對較好，可以幫助縮短病程。
3、冰硼散：主要成分是冰片、硼砂等藥材，具有清熱解毒、消腫止痛的作用，可以用于熱毒蘊結所致的不適癥狀，如口舌生瘡、咽喉疼痛、牙齦腫痛等。
4、復方苯佐卡因凝膠：屬于復方制劑，是由苯佐卡因、苯扎氯銨等藥物組成，臨床上對口腔潰瘍可以達到止痛及治療的目的。
5、西地碘含片：主要成分為分子碘，屬于消毒防腐藥，臨床上主要用于口腔潰瘍、慢性咽喉炎、牙齦炎、牙周炎等疾病的治療。
此外，還有復方氯己定含漱液、康復新液等藥物，對于口腔潰瘍的治療效果較好。平時還需要多吃富含維生素的食物，并注意口腔衛生，有助于避免口腔潰瘍復發。