急性化膿性扁桃體炎的致病菌主要為乙型溶血性鏈球菌，少見金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、腺病毒等。
1.乙型溶血性鏈球菌：乙型溶血性鏈球菌屬于鏈球菌屬的致病菌，具有致病性強的特點。可引起皮膚、皮下組織出現化膿性炎癥、呼吸道感染、流行性咽炎等病癥，屬于急性化膿性扁桃體炎較為常見的致病菌。
2.金黃色葡萄球菌：該菌屬于革蘭氏陽性球菌，屬于臨床上較為常見的化膿性致病菌。急性化膿性扁桃體炎可由該菌感染引起，一般與衛生護理不當有關。
3.肺炎鏈球菌：該菌在化膿性球菌中，肺炎鏈球菌的致病力僅次于金黃色葡萄球菌。若是患者未注意做好護理，可能會因肺炎鏈球菌感染，引起急性化膿性扁桃體炎。
4.流感嗜血桿菌：該菌是一種沒有運動力的革蘭氏陰性桿菌，該菌可引起呼吸道感染，出現急性化膿性炎癥，損害患者的身體健康。
5.腺病毒：該病毒屬于雙鏈病毒，對呼吸道、胃腸道、尿道和膀胱、眼、肝臟等均可感染，誘發急性化膿性炎癥。
建議注意環境衛生護理，減少病菌滋生。