長期吃銀丹心腦通軟膠囊副作用一般有胃腸道反應、過敏反應等，需要遵醫囑進行用藥，避免盲目用藥，防止癥狀加重。具體如下：
銀丹心腦通軟膠囊在臨床上主要是能夠起到行氣止痛、活血化瘀等功效。主要是應用于胸悶、高脂血癥、腦動脈硬化、腦卒中后遺癥的人群。一般在常規用量下不會有明顯的不良反應以及副作用，但是有些極個別的患者在用藥以后，可能會出現胃腸道方面的表現，如燒心、嘔吐等，尤其是本身就有胃腸道功能不好的患者，比如有急性胃炎、胃潰瘍、十二指腸潰瘍等。此外，如果空腹狀態下服用銀丹心腦通軟膠囊，就有可能會刺激胃腸道。另外比較罕見的情況可能會出現過敏反應，服用以后出現皮膚瘙癢、周圍起斑疹、丘疹等。
建議在醫生的指導下進行用藥治療，避免擅自服藥引起不良反應。如果有異常情況，建議及時就醫檢查，對癥治療。日常注意休息，避免過度勞累，清淡飲食，避免辛辣刺激食物。