婦科PCR檢查一般指PCR檢測，HPV在這里是指HPV檢查。通常情況下，PCR檢測和HPV檢查的區別在于定位、目的等不同。具體情況如下：
1.定位不同：PCR檢測是一種檢測方法，是利用一段DNA為模板，在DNA聚合酶和核苷酸底物共同參與下，將該段DNA擴增至足夠數量，以便進行結構和功能分析。而HPV檢查是一種檢查項目，主要是通過染色鏡檢法、DNA檢測法、血清學試驗等來檢查人是否感染了HPV，所以兩者的定位不同。
2.目的不同：PCR檢測是為了快速診斷細菌性傳染病，而HPV檢查主要為了檢查是否攜帶人乳頭瘤病毒。