一般來說，孕39周念珠菌感染在大多數情況下是可以順產的。
念珠菌感染主要引起外陰陰道假絲酵母菌病，這是孕期比較常見的一種陰道炎。在孕39周時，胎兒已經基本發育成熟。如果念珠菌感染癥狀較輕，如僅有少量白色豆腐渣樣分泌物，外陰瘙癢不嚴重，經過適當治療后，一般不會影響順產。
治療念珠菌感染可以使用局部藥物，如克霉唑栓。這種藥物在孕期使用相對安全，能夠有效抑制念珠菌的生長，減輕炎癥癥狀。同時，孕婦要注意個人衛生，保持外陰清潔，可以每天用溫水清洗外陰，勤換內褲，內褲要選擇純棉材質，并且經過陽光暴曬，以減少念珠菌的滋生。
然而，如果念珠菌感染嚴重，出現大量分泌物，外陰紅腫、疼痛，且炎癥上行感染引起羊膜炎等情況，可能會對順產產生一定影響。羊膜炎可能導致胎膜早破、早產等風險增加。如果出現這種情況，醫生會根據孕婦和胎兒的具體情況，如胎兒的心率、羊水量等，綜合評估是繼續順產還是選擇剖宮產。
在分娩過程中，胎兒經過陰道時可能會感染念珠菌，出生后可能會出現鵝口瘡、尿布疹等情況。所以，產后也要注意對新生兒的觀察和護理，如發現新生兒口腔有白色斑點等念珠菌感染癥狀，要及時就醫治療。
如果孕39周發現念珠菌感染，不要過于緊張，及時就醫，在醫生的指導下進行治療和選擇合適的分娩方式。