扁桃體結石很臭可能是正常情況、殘留時間過長導致的，需要采取藥物治療、手術治療等。
一、原因
1、正常情況：扁桃體結石中含有大量的磺胺類物質，同時含有大量的細菌，當扁桃體結石破碎時會散發出類似硫化物氣體，也就是口臭。
2、殘留時間過長：扁桃體結石是由于扁桃體炎反復發作導致隱窩口纖維化，引流受阻，脫落上皮和細菌碎片形成的干酪樣物積存于隱窩內形成的，小者如砂粒，大者如鴿卵。因為殘留時間過長的原因，引起扁桃體發炎，炎癥刺激分泌物增多，散發異味。
二、治療
1、藥物治療：若因結石刺激引起周圍炎癥可以遵醫囑使用阿莫西林膠囊、紅霉素片等藥物，以達到清熱解毒、消腫散結的目的。
2、手術治療：對于頑固性扁桃體結石或結石較大，影響吞咽功能，且保守治療效果不佳者，可以考慮行扁桃體切除術或切開取石術，伴急性感染者應在感染控制后再行手術。
患者平時注意多喝水，保持口腔清潔。養成良好的口腔衛生習慣，早晚刷牙，飯后漱口，以免細菌吸入而致疾病復發。