肺炎支原體IgM陰性分兩種情況，一是未感染肺炎支原體，一是感染后病情已痊愈，需結合IgG綜合判斷。
感染肺炎支原體后，人體會產生兩種抗體，分別為IgM和IgG，其中IgM出現較早，通常在感染支原體1周左右出現，感染3-4周時達到高峰，以后會逐漸消失。IgG出現的較晚，但在體內保持時間較長。如懷疑感染肺炎支原體時，可抽血進行酶聯免疫吸附試驗即可明確。
但發現IgM為陰性時，還不能完全排除支原體感染，還需聯合IgG結果進行判斷。如IgM和IgG都為陰性，就表明未感染過肺炎支原體，沒有患支原體肺炎。如IgM為陰性，但IgG為陽性，表明曾經感染過肺炎支原體，但經過積極治療后，已經消除支原體感染，肺炎支原體IgM陽性轉陰，體內產生抗體，可降低再次感染的幾率。