肛門鏡是常用的檢查肛腸疾病的器械，特點是比較方便，患者不需要經過腸道準備即可在直視下進行操作，肛門鏡可以檢查直腸，但醫生可能無法全面檢查直腸。
直腸分上段、中段及下段，而肛門鏡通常無法探查直腸全部長度，只可以檢查中、下段直腸，不能全面檢查整個直腸的情況，也無法進行錄像、拍照。肛門鏡可以檢查直腸中下段、肛門部、靠近肛門部位齒線位置的病變，包括直腸壁有無異常的增生物、腫塊、痔瘡等情況。通常電子腸鏡發現異常情況后，可直接取活檢做病理檢查，但肛門鏡下取活檢較為復雜。綜上所述，肛門鏡可以檢查直腸，但具有一定的局限性。
當患者在日常生活中出現里急外重、排便不盡感、肛周瘙癢，以及疼痛等癥狀時，建議患者及時前往醫院就診，可在醫生建議下選擇肛門鏡、電子腸鏡等輔助檢查手段以明確病因，并及早進行治療，緩解不適癥狀。