對于20歲的女性來說，面對宮內早孕和先天性心臟病的雙重情況，確實需要謹慎考慮。根據超聲檢查結果，您目前處于約6周左右的早期妊娠階段，同時被診斷為先天性心臟病中的室間隔缺損（膜周部型）。這種情況下，醫生通常會建議選擇人工流產作為終止妊娠的方式。
首先，宮內早孕的處理方式主要有藥物流產和人工流產兩種。藥物流產適用于妊娠早期，但需要嚴格符合適應癥，并在專業醫師指導下進行。而人工流產則更為安全可控，尤其是對于存在先天性心臟病的患者來說，人工流產可以更好地控制手術風險。
其次，您的心臟狀況也需要特別關注。室間隔缺損（膜周部型）屬于先天性心臟病的一種類型，可能導致心臟負荷加重。在妊娠期間，隨著孕周增加，母體的心臟負擔會逐漸加重，尤其是在早期妊娠階段，胚胎發育不良或其他并發癥的風險也會增加。
綜合來看，建議選擇人工流產作為終止妊娠的方式，并前往市級綜合性醫院進行手術。這類醫院通常擁有更完善的心臟超聲評估設備和專業的醫療團隊，能夠更好地應對可能出現的意外情況。
最后，無論選擇哪種方式，都應在專業醫生的指導下完成術前檢查和術后隨訪，確保自身健康安全。