一般情況下，黃體囊腫和畸胎瘤B超的區別在于超聲的回聲高低，且兩者的區別還在于能否自然消失，具體分析如下：
黃體囊腫在B超檢查中可能會出現低回聲腫塊，在月經后可能會自然消失，通常對身體不會造成不良影響，一般不需要進行特殊處理；畸胎瘤有骨骼和毛發成分，在B超檢查中可能提示高回聲腫塊，并且畸胎瘤在任何月經周期檢查都會存在，一般不會自行消退，對身體有一定的影響，可能出現腹痛、腹脹等癥狀，建議患者及時去醫院就診，可以通過手術切除畸胎瘤，以達到較好的治療效果。