兩邊最里面的牙齒隱隱的疼，考慮可能是由智齒冠周炎、齲齒、齦乳頭炎所引起。建議前往醫院進行詳細的檢查，由專業的口腔科醫生進行相應的治療。
1、智齒冠周炎：由于智齒萌出受阻或是受到細菌感染等影響時可能會誘發智齒冠周炎，若兩邊最里面均存在智齒，則可能會出現兩邊最里面的牙齒隱隱的疼的情況，可在醫生的指導下使用生理鹽水含漱以改善癥狀，若情況嚴重時，則可將智齒拔除，以改善癥狀；
2、齲齒：由于長期吃甜食、不注意口腔衛生等因素誘發齲齒，當細菌侵蝕兩邊最里面的牙齒的神經時，可能會出現兩邊最里面的牙齒隱隱的疼的現象，可由專業的醫生根據齲齒的損壞程度使用填充氟化物、鑲制人造牙冠等方式進行治療；
3、齦乳頭炎：由于食物嵌塞未及時處理或者過硬的食物刺傷牙齦等所引起，可表現為牙齦出血、紅腫、脹痛等情況，若發生在兩邊最里面的牙齒，則可能會出現兩邊最里面的牙齒隱隱的疼的情況，可遵醫囑使用阿莫西林膠囊、甲硝唑片等藥物，以改善癥狀。