在進行腎區叩擊痛的檢查時，要先確定腎區位置。腎區通常位于后背，在脊柱與第12肋的夾角處，因此腎區是指兩部分區域，左腎區和右腎區。受檢者應采取立位、坐位或側臥位進行檢查，醫生將左手掌平放在受檢者的腎區，右手呈握拳狀，由輕到中等強度的力量向左手背進行叩擊，兩側要對比進行。如果存在腎炎、腎盂腎炎、腎結石、腎周圍炎等病癥，腎區會產生相應部位的叩擊痛。
腎區叩擊痛有可能出現在單側，也有可能雙側同時出現，此時應該以輕到中等強度的力量進行腎區叩擊。正常人應該沒有疼痛，如果出現腎區叩擊痛即認為腎臟存在異常。腎區叩擊痛的強弱程度與疾病的危險程度并不成正比，有時很小的結石也會造成明顯的腎區叩擊痛。但有時腎臟巨大腫瘤，甚至是惡性腫瘤，卻并不一定產生明顯的腎區叩擊痛。
進行腎區叩擊痛檢查時，需要注意環境的安靜和溫暖，腎區叩擊痛的檢查要按一定順序進行，由上到下、由左到右，兩側進行對比。受檢者應保持肌肉放松、心情放松，有行動能力者通常采用立位或坐位。而對于身體比較弱或重病者而言，可以采用側臥位。但對于昏迷、躁動或神志不清者而言，通常不采取腎區叩擊痛的檢查方法檢測，因為其無法配合檢查或無法回應有無腎區叩擊痛，不能獲取準確的檢查結果。