碘甘油是不能食用的，吃下去之后容易導致不良反應，如惡心、嘔吐、腹痛等。
碘甘油適用于治療口腔黏膜潰瘍、牙齦炎及冠周炎。屬于外用藥物，用棉簽蘸取少量的碘甘油涂于患處，作為消毒防腐劑，可以使菌體蛋白質變性、死亡，對細菌、真菌、病毒均有殺滅作用，可以有效控制炎癥。碘甘油只能用于口腔，如誤服可能會導致中毒，癥狀主要為惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等，部分患者會出現神經性食物中毒反應，如頭痛、頭暈鞥，此時應立即用淀粉糊或米湯灌胃，并前往醫院救治。
用藥部位如有燒灼感、瘙癢、紅腫等情況應停藥，并將局部藥物洗凈，碘甘油不能與堿、生物堿、水合氯醛、苯酚、硫代硫酸鈉、淀粉、鞣酸同用或接觸，容易出現藥物相互作用。因為碘甘油當中含有碘，如果甲狀腺功能亢進癥患者使用過多，可能會導致甲狀腺功能水平異常升高，進而引起患者癥狀進一步加重，可能會出現心慌、手抖、頭暈、胸悶的情況，需要及時停止使用該藥物，因為新生兒的口腔黏膜較脆弱，慎用碘甘油。
用藥期間保證口腔干凈衛生，建議飯后刷牙。