神經遞質一般不是激素，兩者之間有明顯區別，兩者的產生、作用均不相同。激素由人體自身器官、組織等合成，具有調節自身機體內環境平衡的重要作用，而神經遞質是在神經元中合成，由神經末梢釋放的小分子物質。
1、激素：由腦垂體、甲狀腺、胸腺、胰腺、腎上腺等，內分泌，或睪丸、卵巢等器官所分泌的生物活性物質，可隨著血液或淋巴傳布全身，在中樞神經系統的主導作用下，有選擇地參與對人和動物的生理過程和行為活動的調節。每種激素都有特殊的作用，如抗利尿激素的分泌會影響排尿的多少，甲狀腺素的分泌會影響機體的新陳代謝的快慢，以及智力、記憶水平變化等；
2、神經遞質：神經遞質是指通過突觸，將神經信號從一個神經元傳遞到另一個神經元的內源性化學物質，屬于一種信息傳遞物質，可儲存于突觸小泡內。當神經遞質作用過大時，可引起突觸后神經元發生興奮或抑制的反應，常見的神經遞質較多，有乙酰膽堿、5-羥色胺、多巴胺、去甲腎上腺素、腎上腺素谷氨酸以及前列腺素等。
綜上可知，神經遞質和激素都是由體內產生，但產生機制和作用都有明顯的區別，不是一種物質。