根據患者個人情況差異，腦血栓一般沒有溶栓的首選藥物，通常腦血栓溶栓較常選擇的藥物有注射用尿激酶以及注射用阿替普酶。
1、注射用尿激酶：該藥物的主要成分為尿激酶加適量穩定劑和賦形劑的無菌凍干品，可以吸附在血栓的表面，經過激肽酶的作用轉化為尿激酶，起到溶栓作用，適用于治療血栓栓塞性疾病。
2、注射用阿替普酶：注射用阿替普酶的主要成分為阿替普酶，通過阿替普酶發揮作用使纖維蛋白降解，溶解血塊，可用于急性心肌梗死、腦血栓形成等情況中。
此外，如阿司匹林片、卡托普利緩釋片等抗血小板凝聚藥物、擴充血容量藥物，雖然不屬于溶栓藥物，但也有助于改善該情況，患者用藥時應注意謹遵醫囑。